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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6an7C_ | 3.85 | PDB header: transport protein | Chain: C: PDB Molecule: transport permease protein; |
Added to library: Sat Dec 2 08:25:22 2017 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | L | S | L | I | L | E | L | V | R | Q | E | I | K | N | R | Y | A | D | T | V | L | G | I | W | W | A | F | L | W | P | I | L | L | V | L | I | Y | T | L | I | F | S | H | L | I | G | A | K | T | V | Y | A | Y | S | I | Y | L | S | S | G | I | F | P | W | F | F | F | S | N | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | S | T | T | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | L | S | R | I | T | G | I | F | T | E | K | K | F | L | F | T | K | I | P | I | R | L | E | V | F | P | V | V | V | I | I | S | E | L | I | N | Y | L | I | G | I | S | L | V | T | L | I | S | F | I | T | L | G | F | E | G | I | K | Y | F | Y | L | F | P | V | A | L | Y | L | M |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | G | G | G | G | S | S | S | T | S | T | T | S | S | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | I | V | Y | S | F | S | I | G | M | V | L | G | T | L | N | V | F | F | R | D | I | K | E | I | I | G | V | F | L | Q | I | F | F | W | F | T | P | I | V | Y | T | L | D | I | L | P | P | F | V | K | K | L | I | Y | Y | N | P | M | Y | P | V | V | S | I | H | H | L | V | F | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | S | S | S | S | S | S | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||
Sequence | N | Y | L | D | L | H | L | Y | S | L | L | G | F | L | L | A | S | P | L | V | F | F | V | S | Y | Y | F | F | K | K | L | E | K | D | I | K | D | F | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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