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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6agmA_ | 2.00 | PDB header: biosynthetic protein | Chain: A: PDB Molecule: phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase, tyr-sensitive; |
Added to library: Sat Apr 20 08:25:08 2019 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | D | A | L | N | N | V | H | I | T | D | E | Q | V | L | M | T | P | E | Q | L | K | A | A | F | P | L | S | L | Q | Q | E | A | Q | I | A | D | S | R | K | S | I | S | D | I | I | A | G | R | D | P | R | L | L | V | V | C | G | P | C | S | I | H | D | P | E | T | A | L | E | Y |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | T | S | T | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | A | R | R | F | K | A | L | A | A | E | V | S | D | S | L | Y | L | V | M | R | V | Y | F | E | K | P | R | T | T | V | G | W | K | G | L | I | N | D | P | H | M | D | G | S | F | D | V | E | A | G | L | Q | I | A | R | K | L | L | L | E | L | V | N | M | G | L | P | L | A | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | S | S | S | S | S | T | T | S | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | E | A | L | D | P | N | S | P | Q | Y | L | G | D | L | F | S | W | S | A | I | G | A | R | T | T | E | S | Q | T | H | R | E | M | A | S | G | L | S | M | P | V | G | F | K | N | G | T | D | G | S | L | A | T | A | I | N | A | M | R | A | A | A | Q | P | H | R | F | V | G | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | G | G | G | S | T | S | S | S | T | T | G | G | G | G | S | S | T | T | S | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | N | Q | A | G | Q | V | A | L | L | Q | T | Q | G | N | P | D | G | H | V | I | L | R | G | G | K | A | P | N | Y | S | P | A | D | V | A | Q | C | E | K | E | M | E | Q | A | G | L | R | P | S | L | M | V | D | C | S | H | G | N | S | N | K | D | Y | R | R | Q | P | A | V | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | S | S | T | T | S | S | T | T | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 330 | . | . | . | . | . |
Sequence | E | S | V | V | A | Q | I | K | D | G | N | R | S | I | I | G | L | M | I | E | S | N | I | H | E | G | D | A | C | I | S | W | E | M | T | D | A | L | L | R | E | I | H | Q | D | L | N | G | Q | L | T | A | R | V | Y | |||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | B | S | S | B | T | T | T | T | T | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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