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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5znhA_ | 2.40 | PDB header: oxidoreductase | Chain: A: PDB Molecule: catechol 2,3-dioxygenase, extradiol protein; |
Added to library: Sat Apr 20 08:25:25 2019 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | M | G | V | L | R | I | G | H | A | S | L | K | V | M | D | M | D | A | A | V | R | H | Y | E | N | V | L | G | M | K | T | T | M | K | D | K | A | G | N | V | Y | L | K | C | W | D | E | W | D | K | Y | S | V | I | L | T | P | S | D | Q | A | G | M | N | H | L | A | Y | K | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | S | T | T | T | T | B | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | E | K | E | A | D | L | E | A | L | Q | Q | K | I | E | A | W | G | V | K | T | T | M | L | D | E | G | T | L | P | S | T | G | R | M | L | Q | F | K | L | P | S | G | H | E | M | R | L | Y | A | S | K | E | F | V | G | T | D | V | G | N | I | N | P | D | P | W | P | D | G | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | T | T | S | S | T | T | B | T | T | S | S | B | B | T | T | S | S | S | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | K | G | A | G | A | H | W | L | D | H | C | L | L | V | C | E | M | N | P | E | A | G | I | N | T | V | A | D | N | T | R | F | V | T | E | C | L | D | F | F | L | T | E | Q | V | L | V | G | P | G | G | S | I | Q | A | T | T | F | L | A | R | T | T | T | P | H | D | I | A | F |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | G | G | G | T | T | T | S | T | T | S | S | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | V | G | G | P | T | S | G | L | H | H | I | A | F | F | L | D | S | W | H | D | V | L | K | A | A | D | V | M | A | K | N | K | V | R | I | D | V | A | P | T | R | H | G | I | T | R | G | E | T | I | Y | F | F | D | P | S | G | N | R | N | E | T | F | A | G | L | G | Y | L | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | T | T | S | S | T | T | T | T | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||
Sequence | Q | R | D | R | P | V | T | T | W | T | E | D | Q | L | G | S | A | I | F | Y | H | T | G | Y | L | E | P | S | F | T | D | V | Y | T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | G | G | G | S | T | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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