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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5zhzA_ | 1.18 | PDB header: dna binding protein | Chain: A: PDB Molecule: probable endonuclease 4; |
Added to library: Sat Apr 7 08:18:38 2018 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | M | L | I | G | S | H | V | S | P | T | D | P | L | A | A | A | E | A | E | G | A | D | V | V | Q | I | F | L | G | N | P | Q | S | W | K | A | P | K | P | R | D | D | A | A | A | L | K | A | A | T | L | P | I | Y | V | H | A | P | Y | L | I | N | L | A | S | A | N | N | R | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | S | S | S | S | T | T | S | T | T | S | S | S | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | R | I | P | S | R | K | I | L | Q | E | T | C | A | A | A | A | D | I | G | A | A | A | V | I | V | H | G | G | H | V | A | D | D | N | D | I | D | K | G | F | Q | R | W | R | K | A | L | D | R | L | E | T | E | V | P | V | Y | L | E | N | T | A | G | G | D | H | A | M | A | R |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | B | S | S | G | G | G | S | S | S | S | S | B | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | R | F | D | T | I | A | R | L | W | D | V | I | G | D | T | G | I | G | F | C | L | D | T | C | H | T | W | A | A | G | E | A | L | T | D | A | V | D | R | I | K | A | I | T | G | R | I | D | L | V | H | C | N | D | S | R | D | E | A | G | S | G | R | D | R | H | A | N | L | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | G | G | G | T | T | T | S | T | T | S | S | S | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | ||||||||||
Sequence | S | G | Q | I | D | P | D | L | L | V | A | A | V | K | A | A | G | A | P | V | I | C | E | T | A | D | Q | G | R | K | D | D | I | A | F | L | R | E | R | T | G | S | ||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | S | G | G | G | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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