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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5yefJ_ | 2.81 | PDB header: dna binding protein/dna | Chain: J: PDB Molecule: transcriptional repressor ctcf; |
Added to library: Sat Dec 2 08:35:55 2017 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | P | H | K | C | P | D | C | D | M | A | F | V | G | E | L | V | R | H | R | R | Y | K | H | T | H | E | K | P | F | K | C | S | M | C | D | Y | A | S | V | E | V | S | K | L | K | R | H | I | R | S | H | T | G | E | R | P | F | Q | C | S | L | C | S | Y | A | S | R | D | T | Y |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | T | T | T | S | S | S | S | S | S | S | B | T | T | S | S | B | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | K | L | K | R | H | M | R | T | H | S | G | E | K | P | Y | E | C | Y | I | C | H | A | R | F | T | Q | S | G | T | M | K | M | H | I | L | Q | K | H | T | E | N | V | A | K | F | H | C | P | H | C | D | T | V | I | A | R | K | S | D | L | G | V | H | L | R | K | Q | H | S | Y |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||
Sequence | I | E | Q | G | K | K | C | R | Y | C | D | A | V | F | H | E | R | Y | A | L | I | Q | H | Q | K | S | H | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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