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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5xr2D_ | 2.60 | PDB header: chaperone | Chain: D: PDB Molecule: protein/nucleic acid deglycase hcha; |
Added to library: Sat Nov 4 08:23:49 2017 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | N | E | L | S | K | Q | P | T | P | D | K | A | E | D | N | A | F | F | P | S | P | Y | S | L | S | Q | Y | T | A | P | K | T | D | F | D | G | V | E | H | K | G | A | Y | K | D | G | K | W | K | V | L | M | I | A | A | E | E | R | Y | V | L | L | E | N | G | K | M | F | S | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | T | T | S | S | S | S | S | T | T | S | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | G | N | H | P | V | E | M | L | L | P | L | H | H | L | M | E | A | G | F | D | V | D | V | A | T | L | S | G | Y | P | V | K | L | E | L | W | A | M | P | T | E | D | E | A | V | I | S | T | Y | N | K | L | K | E | K | L | K | Q | P | K | K | L | A | D | V | I | K | N | E | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | T | T | S | S | S | B | G | G | G | T | T | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | G | P | D | S | D | Y | L | S | V | F | I | P | G | G | H | A | A | V | V | G | I | S | E | S | E | D | V | Q | Q | T | L | D | W | A | L | D | N | D | R | F | I | V | T | L | C | H | G | P | A | A | L | L | S | A | G | L | N | R | E | K | S | P | L | E | G | Y | S | V | C | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | S | G | G | G | G | S | S | T | T | S | T | T | T | T | T | G | G | G | G | G | G | G | G | G | T | T | S | S | S | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | F | P | D | S | L | D | E | G | A | N | I | E | I | G | Y | L | P | G | R | L | K | W | L | V | A | D | L | L | T | K | Q | G | L | K | V | V | N | D | D | M | T | G | R | T | L | K | D | R | K | L | L | T | G | D | S | P | L | A | S | N | E | L | G | K | L | A | V | N | E | M |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | S | S | S | S | S | T | T | S | S | S | T | T | S | S | G | G | G |   | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | L | N | A | I | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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