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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5x1uB_ | 1.80 | PDB header: protein transport | Chain: B: PDB Molecule: uncharacterized protein; |
Added to library: Sat Jun 17 08:21:56 2017 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | A | L | T | P | X | E | F | A | R | K | Y | N | L | L | R | K | D | D | A | L | L | D | N | P | V | P | G | E | E | X | T | A | G | I | R | R | G | D | A | K | R | V | F | T | X | Q | L | G | P | Y | W | D | G | F | E | R | C | S | P | Q | A | Y | A | L | S | A | V | F | X | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | B | T | T | S | S | T | T | T | T | S | B | B | S | G | G | G | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | R | X | N | R | D | R | D | A | A | N | N | I | L | K | V | L | D | K | T | F | V | D | G | K | P | D | F | S | V | A | R | P | V | X | K | K | Y | Q | N | S | E | L | V | Q | E | V | V | A | K | H | A | Y | V | L | T | V | I | A | S | L | L | E | A | A | R | E | D | G | V | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | S | S | G | G | G | G | T | T | S | T | S | B | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . |
Sequence | P | S | S | E | F | L | W | L | K | P | V | D | R | R | L | W | Y | X | L | N | C | V | G | R | Q | T | P | Y | S | E | V | A | G | P | F | A | H | W | K | A | E | K | E | X | G | R | R | S | L | V | P | X | I | D | E | A | I | R | A | L | E | I | A | V | K | E | V | R | ||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | G | T | T | T | T | S | S | G | G | G | T | S | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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