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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5wx8B_ | 2.50 | PDB header: dna binding protein | Chain: B: PDB Molecule: immediate-early protein 2; |
Added to library: Sat Aug 5 08:23:58 2017 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | K | N | L | K | E | A | V | Y | D | I | C | C | N | G | L | S | N | N | A | A | I | I | X | Y | F | T | R | S | K | K | V | A | Q | I | I | K | I | X | Q | K | E | L | X | I | R | P | N | I | T | V | S | E | A | F | K | X | N | H | A | P | P | K | Y | Y | D | K | D | E | I | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | S | T | S | T | T | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | R | F | I | Q | L | Q | K | Q | G | P | Q | E | L | W | D | K | F | E | N | N | T | T | H | D | L | F | T | R | H | S | D | V | K | T | X | I | I | Y | A | A | T | P | I | D | F | V | G | A | V | K | T | C | N | K | Y | A | K | D | N | P | K | E | I | V | L | R | V | C | S | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | S | T | S | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | I | D | G | D | N | P | I | S | I | Y | N | P | I | S | K | E | F | K | S | K | F | S | T | L | S | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | G | G | G |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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