|
| |||||
  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
  |
Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
---|---|---|---|
c5whmB_ | 1.95 | PDB header: transcription | Chain: B: PDB Molecule: iclr family transcriptional regulator; |
Added to library: Sat Aug 26 08:24:35 2017 | |
  | |
Links to external resources | |
---|---|
  | 1 | . | . | . | . | . | . | . | . | 10 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 20 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 30 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 40 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 50 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 60 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 70 |
Sequence | K | P | T | X | L | T | P | L | E | A | G | V | E | E | E | D | R | Q | F | V | T | A | L | A | R | G | L | E | V | L | R | C | F | T | P | T | E | N | T | L | G | N | Q | E | I | A | H | K | T | G | L | P | K | P | T | V | S | R | L | T | H | T | L | V | R | L | G | Y | L | R |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | T | T | T | T | S | S | S | B | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | Q | D | A | L | S | G | L | Y | Q | L | D | I | G | I | L | R | L | G | Y | A | X | L | S | N | L | X | I | R | T | V | A | S | P | L | X | Q | V | L | A | D | Y | A | K | A | A | V | A | X | A | A | R | D | R | L | S | X | V | Y | L | D | V | V | Q | G | E | T | X | R | R | Q |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | T | T | T | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | I | G | S | T | L | P | L | A | G | S | S | V | G | R | A | C | L | A | A | X | P | E | D | E | R | T | F | I | L | E | H | I | R | E | R | E | P | E | N | W | P | S | I | R | K | G | L | D | R | A | L | R | D | F | E | D | Y | G | Y | C | L | S | I | G | E | W | H | R | D | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | S | S | T | T | T | S | S | S | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | ||
Sequence | N | S | V | A | V | P | L | V | H | K | Q | Y | G | V | L | V | F | N | C | G | G | P | S | F | Q | L | P | R | E | K | L | E | D | D | I | G | P | R | L | I | E | X | V | H | N | I | S | S | A | V | ||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | S | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
Phyre is now FREE for commercial users! All images and data generated by Phyre2 are free to use in any publication with acknowledgement Accessibility Statement
|