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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5vvwA_ | 2.30 | PDB header: ligase | Chain: A: PDB Molecule: udp-n-acetylmuramate--l-alanine ligase; |
Added to library: Sat Jun 3 08:49:03 2017 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | H | R | R | I | H | F | V | G | I | G | G | A | G | M | C | G | I | A | E | V | L | L | N | L | G | Y | E | V | S | G | S | D | L | K | A | S | A | V | T | E | R | L | E | K | F | G | A | Q | I | F | I | G | H | Q | A | E | N | A | D | G | A | D | V | L | V | V | S | S | A | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | T | T | T | T | T | S | S | T | T | S | G | G | G | G | T | T | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | N | R | A | N | P | E | V | A | S | A | L | E | R | R | I | P | V | V | P | R | A | E | M | L | A | E | L | M | R | Y | R | H | G | I | A | V | A | G | T | H | G | K | T | T | T | T | S | L | I | A | S | V | F | A | A | G | G | L | D | P | T | F | V | I | G | G | R | L | N | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | G | G | G | G | S | S | S | S | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | A | G | T | N | A | Q | L | G | A | S | R | Y | L | V | A | E | A | D | E | S | D | A | S | F | L | H | L | Q | P | M | V | A | V | V | T | N | I | D | A | D | H | M | A | T | Y | G | G | D | F | N | K | L | K | K | T | F | V | E | F | L | H | N | L | P | F | Y | G | L | A | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | T | T | S | S | T | T | S | T | T | G | G | G | S | S | T | T | G | G | G | G | T | S | T | T | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | M | C | V | D | D | P | V | V | R | E | I | L | P | Q | I | A | R | P | T | V | T | Y | G | L | S | E | D | A | D | V | R | A | I | N | I | R | Q | E | G | M | R | T | W | F | T | V | L | R | P | E | R | E | P | L | D | V | S | V | N | M | P | G | L | H | N | V | L | N | S | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | G | G | G | S | S | S | T | T | S | T | T | T | T | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||
Sequence | A | T | I | V | I | A | T | D | E | G | I | S | D | E | A | I | V | Q | G | L | S | G | F | Q | G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T |
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