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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5vocB_ | 3.99 | PDB header: viral protein/immune system | Chain: B: PDB Molecule: envelope glycoprotein l; |
Added to library: Sat Jul 8 08:17:44 2017 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | P | T | A | A | E | K | V | P | A | E | C | P | E | L | T | R | R | C | L | L | G | E | V | F | E | G | D | K | Y | E | S | W | L | R | P | L | V | N | V | T | G | R | D | G | P | L | S | Q | L | I | R | Y | R | P | V | T | P | E | A | A | N | S | V | L | L | D | E | A | F | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | T | T | T | T | S | S | T | T | S | S | G | G | G | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | D | T | L | A | L | L | Y | N | N | P | D | Q | L | R | A | L | L | T | L | L | S | S | D | T | A | P | R | W | M | T | V | M | R | G | Y | S | E | C | G | D | G | S | P | A | V | Y | T | C | V | D | D | L | C | R | G | Y | D | L | T | R | L | S | Y | G | R | S | I | F | T | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | S | S | S | T | T | T | T | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | G | G | G | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | H | V | L | G | F | E | L | V | P | P | S | L | F | N | V | V | V | A | I | R | N | E | A | T | R | T | N | R | A | V | R | L | P | V | S | T | A | A | A | P | E | G | I | T | L | F | Y | G | L | Y | N | A | V | K | E | F | C | L | R | H | Q | L | D | P | P | L | L | R | H | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | T | S | S | G | G | G | G | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||
Sequence | D | K | Y | Y | A | G | L | P | P | E | L | K | Q | T | R | V | N | L | P | A | H | S | R | Y | G | P | Q | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | S | S | S | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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