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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5vknA_ | 3.00 | PDB header: transport protein | Chain: A: PDB Molecule: potassium channel subfamily k member 2; |
Added to library: Sat Jul 15 08:29:02 2017 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | S | D | S | A | I | N | V | M | K | W | K | T | V | S | T | I | F | L | V | V | V | L | Y | L | I | I | G | A | T | V | F | K | A | L | E | Q | P | Q | E | I | S | Q | R | T | T | I | V | I | Q | R | E | K | F | L | R | A | H | P | C | V | S | D | Q | E | L | D | E | L | I | Q |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | Q | I | V | A | A | I | N | A | G | S | H | W | D | L | G | S | S | F | F | F | A | G | T | V | I | T | T | I | G | F | G | N | I | S | P | R | T | E | G | G | K | I | F | C | I | I | Y | A | L | L | G | I | P | L | F | G | F | L | L | A | G | V | G | D | Q | L | G | T | I | F |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | T | T | T | S | S | S | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | G | K | G | I | A | K | V | E | D | T | F | I | K | W | N | V | S | Q | T | K | I | R | I | I | S | T | I | I | F | I | L | F | G | C | V | L | F | V | A | L | P | A | V | I | F | K | H | I | E | G | W | S | A | L | D | A | I | Y | F | V | V | I | T | L | T | T | I | G | F | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | S | S | T | T | S | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . |
Sequence | D | Y | V | A | G | G | S | D | I | E | Y | L | D | F | Y | K | P | V | V | W | F | W | I | L | V | G | L | A | Y | F | A | A | V | L | S | M | I | G | D | W | L | R | V | I | A | K | K | T | K | E | A | V | G | E | F | R | A | H | A | A | E | W | T | A | N | V | ||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | T | S | S | S | T | T | T | T | T | S | S | T | T | T | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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