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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5vgcB_ | 2.60 | PDB header: protein binding | Chain: B: PDB Molecule: nleg5-1 effector; |
Added to library: Sat Apr 21 08:22:35 2018 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | V | D | L | T | P | Y | I | L | P | G | V | S | F | L | S | D | I | P | Q | E | T | L | S | E | I | R | N | Q | T | I | R | G | E | A | Q | I | R | L | G | E | L | M | V | S | I | R | P | M | Q | V | N | G | Y | F | M | G | S | L | N | Q | D | G | L | S | N | D | N | I | Q | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | G | G | G | T | T | S | S | S | T | T | S | S | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | G | L | Q | Y | I | E | H | I | E | R | T | L | N | H | G | S | L | T | S | R | E | V | T | V | L | R | E | I | E | M | L | E | N | M | D | L | L | S | N | Y | Q | L | E | E | L | L | D | K | I | E | V | C | A | F | N | V | E | H | S | L | R | T | C | P | V | T | L | C | E | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | G | G | G | T | T | T | T | T | T | T | S | T | T | S | T | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . |
Sequence | E | D | G | V | F | M | R | N | S | M | N | S | N | V | C | M | L | Y | D | K | M | A | L | I | H | L | V | K | T | R | A | A | H | P | L | S | R | E | S | I | A | V | S | M | I | V | G | R | D | N | A | A | F | D | P | D | R | G | N | F | V | L | K | N | ||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | T | S | T | T | B | T | T | T | B | G | G | G | G | G | G | T | T | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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