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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5v5vL_ | 4.11 | PDB header: cell adhesion | Chain: L: PDB Molecule: mam domain-containing glycosylphosphatidylinositol anchor |
Added to library: Sat Jul 8 08:49:13 2017 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | P | A | Q | A | Q | I | V | H | A | G | Q | A | C | V | V | K | E | D | N | I | S | E | R | V | Y | T | I | R | E | G | D | T | L | M | L | Q | C | L | V | T | G | R | P | Q | V | R | W | T | K | E | T | S | V | F | E | T | L | R | I | E | R | I | A | R | T | Q | G | G | R | Y |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | T | T | S | B | B | S | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | Y | C | K | A | E | N | G | V | G | V | P | A | I | K | S | I | R | V | D | V | Q | Y | L | D | E | P | M | L | T | V | H | Q | T | V | K | T | V | F | L | R | C | T | V | N | S | N | P | P | A | R | F | I | W | K | R | G | S | D | T | L | S | N | G | V | D | I | Y | E | P | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | S | S | S | S | S | S | S | S | S | B | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | |||||||||||||
Sequence | Y | T | Q | G | E | T | K | V | L | K | L | K | N | L | R | P | Q | D | Y | A | S | Y | T | C | Q | V | S | V | R | N | V | C | G | I | P | D | K | A | I | T | F | R | L | T | ||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | T | T | S | T | T | G | G | G | B |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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