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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5uj7B_ | 3.39 | PDB header: dna binding protein | Chain: B: PDB Molecule: origin recognition complex subunit 1; |
Added to library: Sat Feb 11 11:23:48 2017 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | E | A | R | L | R | L | H | V | S | A | V | P | E | S | L | P | C | R | E | Q | E | F | Q | D | I | Y | N | F | V | E | S | K | L | L | D | H | T | G | G | C | M | Y | I | S | G | V | P | G | T | G | K | T | A | T | V | H | E | V | I | R | C | L | Q | Q | A | A | Q | A | N | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | S | S | S | T | T | T | T | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | V | P | P | F | Q | Y | I | E | V | N | G | M | K | L | T | E | P | H | Q | V | Y | V | Q | I | L | Q | K | L | T | G | Q | K | A | T | A | N | H | A | A | E | L | L | A | K | Q | F | C | T | T | V | L | L | V | D | E | L | D | L | L | W | T | H | K | Q | D | I | M | Y | N | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | G | G | G | S | S | T | T | S | T | T | S | T | G | G | G | G | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | F | D | W | P | T | H | K | E | A | R | L | V | V | L | A | I | A | N | T | M | D | L | P | E | R | T | R | M | C | F | Q | P | Y | T | Y | S | Q | L | Q | Q | I | L | R | S | R | L | K | H | L | K | I | Q | L | V | A | R | K | V | A | A | L | S | G | D | A | R | R | C | L | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | S | S | S | S | S | S | G | G | G | B | T | T | T | T | T | S | B | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | I | C | R | R | A | T | E | I | C | E | F | V | T | I | A | H | S | M | E | A | V | D | E | M | F | S | S | S | Y | I | T | A | I | K | N | S | S | V | L | E | Q | S | F | L | R | A | I | L | A | E | F | R | R | S | G | L | E | E | A | T | F | Q | Q | I | Y | S | Q | H | V | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 330 | . | . | . | . | . | . | . | |||||
Sequence | L | C | R | M | E | G | L | P | Y | P | T | M | S | E | T | M | A | V | C | S | H | L | G | S | C | R | L | L | L | V | E | P | S | R | N | D | L | L | L | R | V | R | L | N | V | S | Q | D | D | V | L | Y | A | L | K | D | E | |||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | G | G | G | G | G | G | S | S |
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