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| Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 | |||||||
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| Fold library id | PDB Header | Molecule | Title | 
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| c5oqmQ_ | 5.80 | PDB header: transcription | Chain: Q: PDB Molecule: transcription initiation factor iif subunit alpha; | 
| Added to library: Sat May 12 08:20:54 2018 | |
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| Links to external resources | |
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| Sequence | F | I | K | R | D | R | M | R | R | N | F | L | R | M | R | E | Y | N | E | F | P | L | R | A | I | P | K | E | D | L | E | N | M | R | T | H | L | L | K | F | Q | S | K | K | K | I | N | P | V | T | D | F | H | L | P | V | R | L | H | R | K | R | K | T | R | Q | L | K | V | L | 
| Predicted secondary structure |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | ||||||||||||||||||||||||||||||
| SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Known secondary structure (DSSP) |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | S | S | S | S | T | T | S | S |  |  |  |  | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 | 
| Sequence | D | E | N | A | K | K | L | R | F | E | E | F | Y | P | W | V | M | E | D | F | Y | N | T | W | V | G | S | Y | E | A | G | N | S | D | S | Y | V | L | L | S | V | E | D | D | G | S | F | T | M | I | P | A | D | K | V | Y | K | F | T | A | R | N | K | Y | A | T | X | X | X | X | 
| Predicted secondary structure |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Known secondary structure (DSSP) | S |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | T | T | S | S |  |  |  |  |  | S | S | S |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | S | S | T |  |   | . | . | . | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||
| Sequence | X | X | X | X | X | X | X | X | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Known secondary structure (DSSP) |  |  |  |  |  | T | T | 
| Download: | PDB structure | FASTA sequence | 
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