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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5ogeE_ | 3.22 | PDB header: membrane protein | Chain: E: PDB Molecule: gdp-mannose transporter 1; |
Added to library: Sat Nov 25 08:29:55 2017 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | S | V | A | N | S | G | P | I | S | I | L | S | Y | C | G | S | S | I | L | M | T | V | T | N | K | F | V | V | N | L | K | D | F | N | M | N | F | V | M | L | F | V | Q | S | L | V | C | T | I | T | L | I | I | L | R | I | L | G | F | R | S | L | N | K | T | D | A | K | N | W |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | T | T | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | F | P | I | S | F | L | L | V | L | M | I | Y | T | S | S | K | A | L | Q | Y | L | A | V | P | I | Y | T | I | F | K | N | L | T | I | I | L | I | A | Y | G | E | V | L | F | F | G | G | S | V | T | S | M | E | L | S | S | F | L | L | M | V | L | S | S | V | V | A | T | W | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | D | Q | Q | A | V | A | A | A | V | A | S | F | N | P | G | Y | F | W | M | F | T | N | C | I | T | S | A | L | F | V | L | I | M | R | K | R | I | K | L | T | N | F | K | D | F | D | T | M | F | Y | N | N | V | L | A | L | P | I | L | L | L | F | S | F | C | V | E | D | W | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | S | T | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | S | V | N | L | T | N | N | F | S | N | D | S | L | T | A | M | I | I | S | G | V | A | S | V | G | I | S | Y | C | S | G | W | C | V | R | V | T | S | S | T | T | Y | S | M | V | G | A | L | N | K | L | P | I | A | L | S | G | L | I | F | F | D | A | P | R | N | F | L | S | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | L | S | I | F | I | G | F | L | S | G | I | I | Y | A | V | A | K | Q | K | K | Q | Q | A | Q | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |
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