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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5oemA_ | 1.90 | PDB header: transcription | Chain: A: PDB Molecule: interferon regulatory factor 9; |
Added to library: Sat Jan 27 08:20:30 2018 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | E | D | P | V | F | L | E | H | Q | L | P | L | N | S | D | Y | S | L | L | L | T | F | I | Y | G | G | R | V | V | G | K | T | Q | V | H | S | L | D | C | R | L | V | A | E | A | S | D | S | E | S | S | M | E | Q | V | E | F | P | K | P | D | P | L | E | P | T | Q | H | L | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | S | T | T | T | T | S | S | S | S | S | S | S | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | N | Q | L | D | R | G | V | L | V | A | S | N | S | R | G | L | F | V | Q | R | L | C | P | I | P | I | S | W | N | A | P | E | A | P | P | G | P | G | P | H | L | L | P | S | N | K | C | V | E | L | F | K | T | T | Y | F | C | R | D | L | A | Q | Y | F | Q | G | Q | G | P | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | S | S | S | T | T | S | S | S | S | B | B | T | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . |
Sequence | P | K | F | Q | A | T | L | H | F | W | E | E | S | P | G | S | S | H | S | Q | E | N | L | I | T | V | Q | M | E | Q | A | F | A | R | H | L | L | E | K | I | P | E | E | E | K | A | A | L | F | |||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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