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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5o68F_ | 3.08 | PDB header: membrane protein | Chain: F: PDB Molecule: fapf; |
Added to library: Sat Aug 26 08:19:41 2017 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | A | Q | S | V | S | N | L | Y | N | E | A | S | G | F | F | G | N | G | K | F | S | F | E | T | G | I | T | Y | A | R | Y | D | K | A | D | N | W | T | L | D | L | T | G | A | Y | N | L | D | N | R | W | Q | F | D | V | N | V | P | V | V | Y | R | E | S | T | Y | S | V | S | R |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | D | P | T | I | G | D | V | N | F | G | I | A | Y | K | F | L | D | E | S | A | T | M | P | D | A | V | V | S | V | R | V | K | A | P | T | G | K | E | P | F | G | I | K | V | P | E | S | L | P | T | G | N | G | V | W | S | I | T | P | G | L | S | M | V | K | T | F | D | P | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | S | S | S | S | T | T | S | S | S | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | V | L | F | G | S | V | S | Y | T | H | N | L | E | D | S | F | Q | K | V | G | G | K | V | R | L | G | D | S | F | Q | F | G | V | G | V | A | F | A | L | N | E | R | M | S | M | S | F | S | V | S | D | L | I | Q | R | S | K | L | K | P | D | G | G | W | I | V | S | S | D | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||
Sequence | N | A | G | Y | F | N | V | G | M | T | I | A | A | S | E | N | L | T | I | V | P | N | L | A | I | G | M | T | D | D | A | P | D | F | T | F | S | L | K | F | P | Y | Y | F | ||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | S | S | S | B | S | T | T | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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