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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5n3uA_ | 1.89 | PDB header: lyase | Chain: A: PDB Molecule: phycocyanobilin lyase subunit alpha; |
Added to library: Sat Dec 9 08:29:46 2017 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | P | S | V | E | E | F | P | A | E | N | G | P | Q | L | T | P | E | L | A | I | A | N | L | Q | S | S | D | L | S | L | R | Y | Y | A | A | W | W | L | G | K | Y | R | V | K | E | S | A | A | V | D | A | L | I | A | A | L | E | D | E | A | D | R | T | E | L | G | G | Y | P | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | T | T | S | T | T | T | T | S | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | R | R | N | A | A | R | A | L | G | K | L | G | N | R | K | A | V | P | G | L | I | N | C | L | E | C | P | D | F | Y | V | R | E | A | A | A | Q | S | L | E | M | L | K | D | K | T | A | A | P | A | L | I | K | L | L | D | G | G | V | A | Q | A | V | Q | V | T | G | R | P | H |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | G | G | G | T | T | S | S | T | G | G | G | T | T | T | T | T | G | G | G | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | L | V | Q | P | Y | E | A | V | L | E | A | L | G | A | I | G | A | T | D | A | I | P | L | I | Q | P | F | L | E | H | P | V | S | R | V | Q | C | A | A | A | R | A | M | Y | Q | L | T | Q | E | P | V | Y | G | E | L | L | V | K | V | L | A | G | N | D | L | N | L | R | R | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | G | G | G | G | G | G | G | G | S | S | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . |
Sequence | A | L | G | D | L | G | A | I | G | Y | L | A | A | A | E | A | I | A | N | A | K | A | E | N | S | F | K | L | I | A | L | K | G | L | L | E | H | Q | M | S | I | S | D | Q | A | I | R | V | M | N | L | M | D | S | L | L | ||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | G | G | G | S | S | S | T | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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