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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5m47A_ | 2.59 | PDB header: isomerase | Chain: A: PDB Molecule: diaminopimelate epimerase; |
Added to library: Thu Feb 9 17:16:38 2017 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | M | N | L | T | I | P | F | A | K | G | H | A | T | E | N | D | F | I | I | I | P | D | E | D | A | R | L | D | L | T | P | E | M | V | V | T | L | C | D | R | R | A | G | I | G | A | D | G | I | L | R | V | V | K | A | A | D | V | E | G | S | T | V | D | P | S | L | W | F | M |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | T | S | S | G | G | G | S | T | T | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | D | Y | R | N | A | D | G | S | L | A | E | M | C | G | N | G | V | R | L | F | A | H | W | L | Y | S | R | G | L | V | D | N | T | S | F | D | I | G | T | R | A | G | V | R | H | V | D | I | L | Q | A | D | Q | H | S | A | Q | V | R | V | D | M | G | I | P | D | V | T | G | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | B | S | T | T | S | S | S | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | S | T | C | D | I | N | G | Q | V | F | A | G | L | G | V | D | M | G | N | P | H | L | A | C | V | V | P | G | L | S | A | S | A | L | A | D | M | E | L | R | A | P | T | F | D | Q | E | F | F | P | H | G | V | N | V | E | I | V | T | E | L | E | D | D | A | V | S | M | R | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | T | T | T | T | T | T | T | B | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | W | E | R | G | V | G | E | T | R | S | C | G | T | G | T | V | A | A | A | C | A | A | L | A | D | A | G | L | G | E | G | T | V | K | V | C | V | P | G | G | E | V | E | V | Q | I | F | D | D | G | S | T | L | T | G | P | S | A | I | I | A | L | G | E | V | Q | I | H | H | H |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | T | T | S | S | T | T | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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