|
| |||||
  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
  |
Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
---|---|---|---|
c5lj5O_ | 3.80 | PDB header: splicing | Chain: O: PDB Molecule: pre-mrna-splicing factor cef1; |
Added to library: Thu Feb 9 23:05:38 2017 | |
  | |
Links to external resources | |
---|---|
  | 1 | . | . | . | . | . | . | . | . | 10 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 20 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 30 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 40 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 50 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 60 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 70 |
Sequence | V | W | T | N | V | E | D | Q | I | L | K | A | A | V | Q | K | Y | G | T | H | Q | W | S | K | V | A | S | L | L | Q | K | K | T | A | R | Q | S | E | L | R | W | N | E | Y | L | N | P | K | L | N | F | T | E | F | S | K | E | E | D | A | Q | L | L | D | L | A | R | E | L | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | T | S | S | S | S | T | T | T | T | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | N | Q | W | R | T | I | A | D | M | M | A | R | P | A | Q | V | C | V | E | R | Y | N | R | L | L | E | D | E | E | K | E | M | L | A | E | A | R | A | R | L | L | N | T | Q | G | K | K | A | T | R | K | I | R | E | R | M | L | E | E | S | K | R | I | A | E | L | Q | K | R | R |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | E | L | K | Q | A | G | I | N | V | A | I | K | K | P | K | K | K | Y | G | T | D | I | D | Y | N | E | D | I | V | Y | E | Q | A | P | M | P | G | I | Y | D | T | S | T | E | D | R | Q | I | K | K | K | F | E | Q | F | E | R | K | T | E | V | L | L | E | S | I | Q | S | K | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | S | S | S | T | T | S | S | S | S | S | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | E | S | I | E | Q | L | Q | R | K | L | Q | H | V | Q | P | L | E | Q | Q | N | N | E | M | C | S | T | L | C | H | H | S | L | P | A | L | I | E | G | Q | R | K | Y | Y | A | D | Y | Y | A | Y | R | Q | E | I | R | S | L | E | G | R | R | K | R | L | Q | A | M | L | N | S | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | T | T | T | T | T | T | T | T | S |   | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | S | S | I | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
Phyre is now FREE for commercial users! All images and data generated by Phyre2 are free to use in any publication with acknowledgement Accessibility Statement
|