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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5l80B_ | 2.80 | PDB header: rna binding protein | Chain: B: PDB Molecule: maternal protein exuperantia,maternal protein exuperantia; |
Added to library: Sat Jul 9 08:26:12 2016 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | L | P | A | G | N | Y | I | L | V | G | V | D | I | D | T | T | G | R | R | L | M | D | E | I | V | Q | L | A | A | Y | T | P | T | D | H | F | E | Q | Y | I | M | P | Y | M | N | L | N | P | A | A | R | Q | R | H | Q | V | R | V | I | S | I | G | F | Y | R | M | L | K | S | M |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | T | T | S | S | S | B | S | S | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | Q | T | Y | K | I | I | K | S | K | S | E | I | A | A | L | K | D | F | L | N | W | L | E | Q | L | K | T | K | A | G | P | S | S | D | G | I | V | L | I | Y | H | E | E | R | K | F | I | P | Y | M | I | L | E | S | L | K | K | Y | G | L | L | E | R | F | T | A | S | V | K | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | B | T | T | S | S | S | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | F | A | N | S | I | N | L | A | K | A | S | I | K | N | Y | S | L | R | K | L | S | K | I | L | S | L | D | A | D | S | L | F | D | G | N | A | S | V | R | A | K | L | A | F | D | V | A | L | Q | L | S | N | S | S | S | E | A | L | E | N | M | F | N | A | I | R | P | F | A | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | S | T | T | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . |
Sequence | L | V | V | S | D | V | L | E | L | D | I | Q | I | F | L | N | Y | F | K | T | T | L | Y | H | R | V | R | A | V | K | F | R | I | V | L | A | E | N | G | F | G | L | D | I | A | L | Q | K | S | K | D | K | A | E | L | L | E | L | L | |||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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