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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5l3xA_ | 2.75 | PDB header: transcription | Chain: A: PDB Molecule: negative elongation factor a; |
Added to library: Sat Jun 25 08:17:35 2016 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | E | S | D | T | G | L | W | L | H | N | K | L | G | A | T | D | E | L | W | A | P | P | S | I | A | S | L | L | T | A | A | V | I | D | N | I | R | L | C | F | H | G | L | S | S | A | V | K | L | K | L | L | L | G | T | L | H | L | P | R | R | T | V | D | E | M | K | G | A | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | T | T | S | G | G | G | G | G | G | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | M | E | I | I | Q | L | A | S | L | D | S | D | P | W | V | L | M | V | A | D | I | L | K | S | F | P | D | T | G | S | L | N | L | E | L | E | E | Q | N | P | N | V | Q | D | I | L | G | E | L | R | E | K | V | G | E | C | E | A | S | A | M | L | P | L | E | C | Q | Y | L | N |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | T | T | S | S | T | T | T | T | T | G | G | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | ||||||||||||||
Sequence | K | N | A | L | T | T | L | A | G | P | L | T | P | P | V | K | H | F | Q | L | K | R | K | P | K | S | A | T | L | R | A | E | L | L | Q | K | S | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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