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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5klhB_ | 1.65 | PDB header: membrane protein | Chain: B: PDB Molecule: surface glycoprotein; |
Added to library: Sat Jul 8 08:19:37 2017 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | D | D | P | R | D | N | F | K | K | A | V | S | A | F | D | P | K | P | L | E | S | W | T | G | T | F | S | D | V | K | A | T | V | R | R | Q | S | L | S | V | A | G | L | G | S | I | P | S | V | Y | T | E | A | T | V | P | V | S | G | N | T | D | G | S | Q | L | V | V | K | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | G | G | T | T | T | T | S | S | T | T | S | B | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | N | I | N | T | V | A | P | F | T | R | R | S | P | L | H | A | T | R | E | R | W | F | S | C | S | S | S | Q | C | S | G | Y | S | R | K | C | D | C | Q | E | K | H | E | Q | F | R | N | K | C | Y | S | Q | G | G | Q | Y | S | T | Q | S | S | K | C | R | L | G | E | K | C | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | B | S | G | G | G | S | S | S | S | B | T | T | S | T | T | B | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | Y | C | K | Q | E | V | Y | L | S | K | L | Y | L | V | A | A | S | D | G | K | G | E | Y | R | E | S | T | Q | Y | Q | S | A | L | Y | S | F | G | H | L | S | Q | G | Y | E | A | V | P | Q | D | K | V | Q | V | Q | L | Y | S | E | G | D | P | F | I | A | L | E | R | E | T | M |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | S | S | T | T | T | T | S | S | S | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | G | E | G | E | F | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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