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| Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 | |||||||
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| Fold library id | PDB Header | Molecule | Title | 
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| c5jzgA_ | 3.16 | PDB header: virus | Chain: A: PDB Molecule: capsid protein vp1; | 
| Added to library: Sat Jul 16 08:15:56 2016 | |
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| Links to external resources | |
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| Sequence | I | E | T | R | Y | V | Y | N | T | N | T | N | A | E | A | D | V | E | M | F | L | G | R | S | A | L | W | G | K | V | T | L | T | R | Q | Y | A | K | W | E | I | N | F | Q | E | Q | A | H | I | R | K | K | F | E | F | F | T | Y | L | R | F | D | M | E | V | T | I | V | T | N | 
| Predicted secondary structure |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | |||||||||||||||||||||
| SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | T | T | S |  |  |  |  | S | S |  |  |  |  |  |  |  | G | G | G |  |  |  |  |  | S | S | S |  |  |  |  |  |  |  | T | T | B | S |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 | 
| Sequence | N | K | G | L | M | Q | I | M | F | V | P | P | G | I | D | H | P | E | T | H | D | D | R | K | W | D | S | A | S | N | P | S | V | F | F | Q | P | K | S | G | F | P | R | F | T | I | P | F | T | G | L | A | S | A | Y | Y | M | F | Y | D | G | Y | D | K | P | K | G | S | D | N | 
| Predicted secondary structure |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Known secondary structure (DSSP) | S |  |  |  |  |  |  | T | T | S | S | T | T | G | G | G | S | S | S |  |  |  |  | T | T | T |  |  |  |  | S | S | S | S |  |  | S | S | S | B | S | S | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 | 
| Sequence | N | E | Y | G | I | A | P | T | N | D | M | G | L | L | C | F | R | T | L | D | N | S | G | G | N | D | V | K | I | Y | V | K | P | K | H | I | T | A | W | V | P | R | P | P | R | A | T | Q | Y | T | H | K | Y | S | T | N | Y | H | Y | K | P | N | S | S | G | P | D | E | H | V | 
| Predicted secondary structure |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Known secondary structure (DSSP) | B | S | S | T | T | T |  |  |  |  |  | S | S | S |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | S | B | B | S | S | S | S | S | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | ||||||||||||||
| Sequence | L | K | D | R | H | F | I | K | T | R | P | L | I | S | S | A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Predicted secondary structure |  |  |  |  |  |  |  |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Known secondary structure (DSSP) | B | S | S | T | T | 
| Download: | PDB structure | FASTA sequence | 
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