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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5jyfB_ | 2.62 | PDB header: oxidoreductase | Chain: B: PDB Molecule: glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase; |
Added to library: Sat Feb 11 00:18:59 2017 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | V | G | I | N | G | F | G | R | I | G | R | L | A | F | R | R | I | Q | N | V | E | G | V | E | V | R | I | N | D | L | T | D | P | N | M | L | A | H | L | L | K | Y | D | T | T | Q | G | R | F | D | G | T | V | E | V | G | G | F | E | V | N | G | Q | F | V | K | V | S | A | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | T | S | S | T | T | T | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | R | E | P | E | A | T | G | F | F | A | S | K | E | K | A | E | Q | D | V | K | T | V | V | F | N | T | N | H | D | I | G | T | E | T | V | I | S | G | A | S | C | T | T | N | C | L | A | P | M | A | K | A | L | Q | D | N | F | G | V | K | Q | G | L | M | T | T | I | H | A | Y |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | S | S | T | T | T | S | T | T | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | T | G | D | Q | M | I | L | D | G | P | H | R | G | G | D | L | R | R | A | R | A | G | A | A | N | I | V | P | N | S | T | G | A | A | K | A | I | G | L | V | I | P | E | L | N | G | K | L | D | G | A | A | Q | R | V | P | V | P | T | G | S | V | T | E | L | V | A | T | L | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | B | S | S | S | T | T | T | T | T | T | S | B | T | T | S | S | S | T | T | G | G | G | G | G | T | G | G | G | T | T | T | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | K | D | V | T | V | E | E | V | N | A | A | M | K | A | A | A | N | D | S | Y | G | Y | T | E | D | P | I | V | S | S | D | I | V | G | I | S | Y | G | S | L | F | D | A | T | Q | T | K | V | Q | T | V | D | G | N | Q | L | V | K | V | V | S | W | Y | D | N | E | M | S | Y | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | G | G | G | G | T | T | S | S | G | G | G | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | S | Q | L | V | R | T | L | E | Y | F | A | K | I | A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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