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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5jvbB_ | 1.95 | PDB header: transport protein | Chain: B: PDB Molecule: phosphonate abc transporter, periplasmic phosphonate- |
Added to library: Sat Dec 2 08:23:33 2017 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | N | K | A | N | P | Q | K | L | V | V | A | L | L | P | D | E | S | A | A | T | V | I | Q | N | N | K | G | L | E | M | Y | L | E | N | K | L | N | K | D | I | E | L | F | V | S | T | D | Y | S | S | M | I | E | V | A | S | K | G | R | L | D | L | A | Y | F | G | P | L | S | Y |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | T | S | S | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | V | L | A | K | T | K | S | N | I | E | P | F | A | A | L | E | K | D | G | K | N | T | Y | Q | A | L | V | I | G | N | A | E | A | G | I | N | S | Y | E | K | I | E | G | K | I | M | A | Y | G | D | Q | A | S | T | S | S | H | L | I | P | K | S | M | L | K | Q | K | Q | L | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | B | T | T | B | T | T | T | T | S | T | T | S | T | T | T | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | A | G | E | N | Y | E | E | V | F | V | G | A | H | D | A | V | A | I | A | V | A | N | G | K | A | Q | A | G | G | L | S | K | P | I | F | T | A | L | I | E | R | G | T | I | D | K | N | K | V | I | I | I | A | E | S | K | P | F | P | Q | Y | P | W | T | M | R | S | D | L | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | T | T | T | B | S | S | T | T | S | S | S | T | T | S | S | G | G | G | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | |||
Sequence | S | E | L | K | T | Q | I | Q | Q | A | F | L | E | L | E | D | K | A | I | L | K | P | F | K | A | D | A | F | T | L | V | T | D | Q | D | Y | D | V | V | R | N | L | G | E | ||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | G | G | G | G |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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