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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5jp3A_ | 2.90 | PDB header: hydrolase | Chain: A: PDB Molecule: xanthomonas outer protein d; |
Added to library: Sat Jul 30 14:20:52 2016 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | P | E | R | I | D | V | D | N | L | P | S | P | Q | D | V | A | D | P | E | L | P | P | V | R | A | T | S | W | L | L | D | G | H | L | R | A | Y | T | D | D | L | A | R | R | L | R | G | E | P | N | A | H | L | L | H | F | A | D | S | Q | V | V | T | M | L | S | S | A | D | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | G | G | G | S | T | T | S | S | T | T | S | T | T | G | G | G | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | D | Q | Q | A | R | A | Q | R | L | L | A | G | D | D | I | P | P | I | V | F | L | P | I | N | Q | P | N | A | H | W | S | L | L | V | V | D | R | R | N | K | D | A | V | A | A | Y | H | Y | D | S | M | A | Q | K | D | P | Q | Q | R | Y | L | A | D | M | A | A | Y | H | L | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | S | S | T | T | T | S | S | T | T | S | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . |
Sequence | L | D | Y | Q | Q | T | H | E | M | P | I | A | I | Q | S | D | G | Y | S | C | G | D | H | V | L | T | G | I | E | V | L | A | H | R | V | L | D | G | T | F | D | Y | A | G | G | R | D | L | T | D | I | E | P | D | R | G | L | I | R | D | R | L | A | Q | A | |||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | B | S | S | S | S | T | G | G | G | S | T | T | T | T | B | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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