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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5jp2A_ | 2.40 | PDB header: signaling protein | Chain: A: PDB Molecule: f-bar domain only protein 1; |
Added to library: Sat Jun 11 08:20:28 2016 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | L | S | A | Q | E | S | W | P | V | A | A | A | I | T | E | Y | I | N | A | Y | F | R | G | G | E | H | N | R | C | L | V | K | I | T | G | D | L | T | M | S | F | P | A | G | I | T | R | I | F | T | A | N | P | N | A | P | V | L | S | F | R | L | V | N | I | S | R | V | D | H |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | T | T | T | T | T | T | T | T | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | F | L | P | N | Q | K | L | L | Y | S | D | P | S | Q | S | D | P | D | T | K | D | F | W | F | N | M | Q | A | L | T | L | H | L | Q | R | E | A | E | L | N | P | Q | A | S | Y | Y | N | V | A | L | L | K | Y | Q | A | S | S | Q | D | P | S | R | A | P | L | L | L | S | A | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | S | S | T | T | S | S | G | G | G | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | C | Q | R | S | G | T | V | T | R | V | S | L | D | Y | H | C | C | P | A | T | A | P | A | T | Q | L | T | S | V | Q | V | L | L | P | L | D | H | S | A | T | D | L | Q | C | Q | P | P | A | A | W | N | A | E | E | R | R | L | L | W | K | L | A | N | L | S | P | T | N | H | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | S | S | S | B | T | T | S | T | T | T | T | B | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . |
Sequence | K | G | S | G | T | L | C | A | S | W | Q | C | L | E | G | P | A | P | S | L | A | V | Q | F | V | G | S | G | A | S | L | S | G | L | D | V | E | L | V | G | S | R | Y | R | M | S | L | V | K | K | R | F | A | T | G | K | Y | M | A | G | C | S | ||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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