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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5jo8A_ | 1.40 | PDB header: structural protein | Chain: A: PDB Molecule: cep104; |
Added to library: Sat Jul 23 08:23:27 2016 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | E | P | E | P | L | S | E | K | A | L | R | E | A | S | P | A | I | E | V | F | G | E | A | L | V | S | G | A | Y | S | K | S | W | S | Y | R | E | D | A | L | L | A | V | Y | K | K | L | M | E | M | S | V | S | T | P | K | E | D | L | R | N | M | L | R | A | A | I | F | L | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | R | R | A | I | K | D | I | V | S | S | V | F | Q | A | S | L | K | L | L | K | M | I | I | T | Q | Y | V | P | K | H | K | L | G | K | L | E | T | S | H | C | V | E | K | T | L | P | G | L | L | S | R | T | G | D | S | S | S | R | L | R | I | V | A | A | K | F | I | Q | E | M |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | T | T | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | A | L | W | S | E | V | K | P | L | Q | I | V | P | V | H | L | V | Q | L | L | K | P | N | S | P | T | H | L | A | M | S | R | V | E | L | V | E | C | L | L | K | E | M | G | T | E | N | S | G | F | T | I | S | N | V | M | K | F | A | T | G | A | L | E | H | R | V | Y | E | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | G | G | G | T | S | T | T | S | S | S | S | S | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | |||
Sequence | R | D | V | A | L | R | I | I | F | G | M | Y | R | K | H | K | A | A | I | L | E | Y | L | P | P | D | D | A | S | I | R | K | T | V | L | Y | K | T | L | F | D | G | F | T | K | I | ||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | G | G | G | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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