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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5j98A_ | 2.60 | PDB header: virus | Chain: A: PDB Molecule: vp1; |
Added to library: Sat Jun 11 08:17:03 2016 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | M | E | R | T | F | T | P | N | V | M | Q | P | T | P | L | L | P | T | T | N | D | G | R | V | T | F | G | E | A | F | N | D | L | K | D | L | A | R | R | Y | Q | L | Y | W | E | G | T | I | L | E | G | N | L | R | A | I | R | R | N | S | A | L | V | Q | L | P | L | Y | P | H |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | S | S | S | T | T | T | T | T | T | S | S | S | T | T | S | G | G | G | S | S | S | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | G | L | R | I | Q | P | D | V | N | N | P | I | W | N | I | M | R | D | G | H | I | P | V | I | S | S | G | F | R | Y | F | R | G | G | L | R | L | R | I | V | V | E | G | L | N | S | C | V | W | V | Q | H | H | P | D | R | P | S | I | F | S | R | P | I | I | G | R | Y | I | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | T | T | B | T | S | T | T | B | S | S | S | T | T | S | S | S | S | G | G | G | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | A | K | D | A | Y | R | N | H | A | Y | A | A | Y | V | Q | N | M | S | V | N | R | T | I | E | V | E | V | P | F | Y | Q | P | G | L | Y | G | M | L | N | A | S | D | N | N | T | A | N | S | F | D | R | L | R | F | T | G | L | G | D | L | L | I | G | I | E | G | E | Q | P | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | T | T | T | S | S | S | S | S | S | S | S | T | T | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | ||||||
Sequence | P | K | E | G | I | E | I | S | V | Y | Y | S | I | A | D | D | F | S | F | N | I | F | C | G | F | P | P | M | V | Y | C | D | E | T | Y | S | A | A | T | P | D | L | ||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | B | B | G | G | G | T | S | T | T | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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