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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5j8jA_ | 2.72 | PDB header: hydrolase | Chain: A: PDB Molecule: histone deacetylase hda1; |
Added to library: Sat Apr 22 08:19:21 2017 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | H | H | H | H | G | S | M | L | Q | K | A | I | R | Q | Q | Q | Q | H | Y | L | S | D | E | F | N | F | V | T | L | P | L | V | S | M | D | L | P | D | N | T | V | L | C | T | P | N | I | S | E | S | N | T | I | I | I | V | V | H | D | T | S | D | I | W | A | K | R | N | V | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | G | G | G | T | T | G | G | G | S | S | B | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | S | G | T | I | D | L | S | S | S | V | I | I | D | N | S | L | D | F | I | K | W | G | L | D | R | K | Y | G | I | I | D | V | N | I | P | L | T | L | F | E | P | D | N | Y | S | G | M | I | T | S | Q | E | V | L | I | Y | L | W | D | N | Y | I | K | Y | F | P | S | V | A | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | B | G | G | G | T | T | T | T | T | S | S | S | S | T | T | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | I | A | F | I | G | I | G | D | S | Y | S | G | I | V | H | L | L | G | H | R | D | T | R | A | V | T | K | T | V | I | N | F | L | G | D | K | Q | L | K | P | L | V | P | L | V | D | E | T | L | S | E | W | Y | F | K | N | S | L | I | F | S | N | N | S | H | Q | C | W | K | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | S | T | T | T | T | S | S | S | T | T | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | ||||||||||||||||||
Sequence | P | R | K | K | F | G | R | V | L | R | C | D | T | D | G | L | N | N | I | I | E | E | R | F | E | E | A | T | D | F | I | L | D | S | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | S | S | S | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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