|
| |||||
  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
  |
Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
---|---|---|---|
c5iyaT_ | 5.40 | PDB header: transcription, transferase/dna | Chain: T: PDB Molecule: general transcription factor iif subunit 2; |
Added to library: Sat May 21 08:45:14 2016 | |
  | |
Links to external resources | |
---|---|
  | 1 | . | . | . | . | . | . | . | . | 10 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 20 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 30 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 40 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 50 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 60 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 70 |
Sequence | A | E | R | G | E | L | D | L | T | G | A | K | Q | N | T | G | V | W | L | V | K | V | P | K | Y | L | S | Q | Q | W | A | K | A | S | G | R | G | E | V | G | K | L | R | I | A | K | T | Q | G | R | T | E | V | S | F | T | L | N | E | D | L | A | N | E | H | P | F | V | L | Q |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | B | T | T | T | B | T | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | S | V | G | G | Q | T | L | T | V | F | T | E | S | S | S | D | K | L | S | L | E | G | I | V | V | Q | R | A | E | C | R | P | A | A | S | E | N | Y | M | R | L | K | R | L | Q | I | E | E | S | S | K | P | V | R | L | S | Q | Q | L | D | K | V | V | T | T | N | Y | K | P | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | S | S | S | S | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | A | N | H | Q | Y | N | I | E | Y | E | R | K | K | K | E | D | G | K | R | A | R | A | D | K | Q | H | V | L | D | M | L | F | S | A | F | E | K | H | Q | Y | Y | N | L | K | D | L | V | D | I | T | K | Q | P | V | V | Y | L | K | E | I | L | K | E | I | G | V | Q | N | V | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | T | T | S | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | G | I | H | K | N | T | W | E | L | K | P | E | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
Phyre is now FREE for commercial users! All images and data generated by Phyre2 are free to use in any publication with acknowledgement Accessibility Statement
|