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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5iy8R_ | 7.90 | PDB header: transcription, transferase/dna | Chain: R: PDB Molecule: transcription initiation factor iie subunit beta; |
Added to library: Sat May 21 08:47:04 2016 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | F | G | V | L | A | K | I | V | N | Y | M | K | T | R | H | Q | R | G | D | T | H | P | L | T | L | D | E | I | L | D | E | T | Q | H | L | D | I | G | L | K | Q | K | Q | W | L | M | T | E | A | L | V | N | N | P | K | I | E | V | I | D | G | K | Y | A | F | K | P | K | Y | N |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | B | T | T | G | G | G | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | V | R | D | K | K | A | L | L | R | L | L | D | Q | H | D | Q | R | G | L | G | G | I | L | L | E | D | I | E | E | A | L | P | N | S | Q | K | A | V | K | A | L | G | D | Q | I | L | F | V | N | R | P | D | K | K | K | I | L | F | F | N | D | K | S | C | Q | F | S | V | D | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | S | T | T | T | T | S | T | T | T | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||
Sequence | E | F | Q | K | L | W | R | S | V | T | V | D | S | M | D | E | E | K | I | E | E | Y | L | K | R | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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