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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5iy72_ | 8.60 | PDB header: transcription, transferase/dna | Chain: 2: PDB Molecule: general transcription factor iih subunit 4; |
Added to library: Sat May 21 08:48:36 2016 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | P | G | V | L | D | R | L | Y | G | H | P | A | T | C | L | A | V | F | R | E | L | P | S | L | A | K | N | W | V | M | R | M | L | F | L | K | K | E | F | S | K | A | Q | E | E | S | T | G | L | L | S | G | L | R | I | W | H | T | Q | L | L | N | L | R | I | A | L | L | G | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | S | S | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | G | K | A | W | S | D | D | T | S | Q | L | G | P | D | K | H | V | L | H | F | M | V | G | S | P | S | A | A | V | S | Q | D | L | A | Q | L | L | S | Q | A | G | L | M | K | S | T | E | P | G | E | P | P | C | I | T | S | A | G | F | Q | F | L | L | L | D | T | P | A | Q | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | W | Y | F | M | L | Q | Y | L | Q | T | A | Q | S | R | G | M | D | L | V | E | I | L | S | F | L | F | Q | L | S | F | S | T | L | G | K | D | Y | S | V | E | G | M | S | D | S | L | L | N | F | L | Q | H | L | R | E | F | G | L | V | F | Q | R | T | D | Q | I | R | L | W | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | T | G | G | G | G | G | G | G | T | T | T | T | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . |
Sequence | L | E | R | D | R | L | R | F | T | E | G | V | L | Y | N | Q | F | L | S | Q | V | D | F | E | L | L | L | A | H | A | R | E | L | G | V | L | V | F | E | N | S | A | K | R | L | M | V | V | T | P | A | G | H | S | D | V | K | R | F | W | K | R | Q | K | ||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | T | T | T | S | T | T | T | T | G | G | G | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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