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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5iy70_ | 8.60 | PDB header: transcription, transferase/dna | Chain: 0: PDB Molecule: general transcription factor iih subunit 2; |
Added to library: Sat May 21 08:46:05 2016 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | R | L | G | M | M | R | H | L | Y | V | V | V | D | G | S | R | T | M | E | D | Q | D | L | K | P | N | R | L | T | C | T | L | K | L | L | E | Y | F | V | E | E | Y | F | D | Q | N | P | I | S | Q | I | G | I | I | V | T | K | S | K | R | A | E | K | L | T | E | L | S | G | N |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | G | G | G | G | T | T | S | T | T | S | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | P | R | K | H | I | T | S | L | K | K | A | V | D | M | T | C | H | G | E | P | S | L | Y | N | S | L | S | I | A | M | Q | T | L | K | H | M | P | G | H | T | S | R | E | V | L | I | I | F | S | S | L | T | T | C | D | P | S | N | I | Y | D | L | I | K | T | L | K | A | A | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | S | T | T | S | S | S | S | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | ||||||||
Sequence | I | R | V | S | V | I | G | L | S | A | E | V | R | V | C | T | V | L | A | R | E | T | G | G | T | Y | H | V | I | L | D | E | S | H | Y | K | E | L | L | T | H | H | V | S | P | P | P | A | ||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | S | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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