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| Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 | |||||||
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| Fold library id | PDB Header | Molecule | Title | 
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| c5ivaB_ | 2.99 | PDB header: transport protein | Chain: B: PDB Molecule: lps-assembly lipoprotein lpte; | 
| Added to library: Sat May 21 08:45:10 2016 | |
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| Sequence | N | T | S | G | F | Q | L | R | G | L | G | D | A | Q | F | A | L | K | E | I | D | V | S | A | R | N | A | Y | G | P | T | V | R | E | L | K | E | T | L | E | N | S | G | V | K | V | T | S | N | A | P | Y | H | L | V | L | V | R | E | D | N | Q | Q | R | T | V | S | Y | T | G | 
| Predicted secondary structure |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | T | T | S |  |  |  |  |  |  | S | S | S | S | S |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | T |  |  | S | S | S |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 | 
| Sequence | S | A | R | G | A | E | F | E | L | T | N | T | I | N | Y | E | I | V | G | A | N | D | L | V | L | M | S | N | Q | V | Q | V | Q | K | V | Y | V | H | D | E | N | N | L | I | G | S | D | Q | E | A | A | Q | L | R | S | E | M | R | R | D | L | I | Q | Q | L | S | M | R | L | Q | 
| Predicted secondary structure |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | ||||||||||
| SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Known secondary structure (DSSP) | T | S |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | G | G | G |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | T | T |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | 
| Sequence | A | L | T | P | A | Q | L | D | E | A | Q | R | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Predicted secondary structure |  |  |  |  |  |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | 
| Download: | PDB structure | FASTA sequence | 
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