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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5ihwA_ | 1.25 | PDB header: membrane protein | Chain: A: PDB Molecule: serine-aspartate repeat-containing protein e; |
Added to library: Sat Mar 25 08:56:57 2017 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | N | N | V | N | D | L | I | K | V | T | K | Q | T | I | K | V | G | D | G | K | D | N | V | A | A | A | H | D | G | K | D | I | E | Y | D | T | E | F | T | I | D | N | K | V | K | K | G | D | T | M | T | I | N | Y | D | K | N | V | I | P | S | D | L | T | D | K | N | D | P | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | G | G | G | G | G | G | T | T | S | S | T | T | T | T | T | T | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | D | I | T | D | P | S | G | E | V | I | A | K | G | T | F | D | K | A | T | K | Q | I | T | Y | T | F | T | D | Y | V | D | K | Y | E | D | I | K | S | R | L | T | L | Y | S | Y | I | D | K | K | T | V | P | N | E | T | S | L | N | L | T | F | A | T | A | G | K | E | T | S | Q |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | T | S | S | T | T | T | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | N | V | T | V | D | Y | Q | D | P | M | V | H | G | D | S | N | I | Q | S | I | F | T | K | L | D | E | D | K | Q | T | I | E | Q | Q | I | Y | V | N | P | L | K | K | S | A | T | N | T | K | V | D | I | A | G | S | Q | V | D | D | Y | G | N | I | K | L | G | N | G | S | T | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | S | T | T | S | T | T | S | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | I | D | Q | N | T | E | I | K | V | Y | K | V | N | S | D | Q | Q | L | P | Q | S | N | R | I | Y | D | F | S | Q | Y | E | D | V | T | S | Q | F | D | N | K | K | S | F | S | N | N | V | A | T | L | D | F | G | D | I | N | S | A | Y | I | I | K | V | V | S | K | Y | T | P | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | T | T | T | T | S | S | G | G | G | S | G | G | G | G | T | T | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | |||||||||||
Sequence | S | D | G | E | L | D | I | A | Q | G | T | S | M | R | T | T | D | K | Y | G | Y | Y | N | Y | A | G | Y | S | N | F | I | V | T | S | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | S |
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