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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5hy3A_ | 3.10 | PDB header: toxin/antitoxin | Chain: A: PDB Molecule: mrna endoribonuclease lsoa; |
Added to library: Sat Jun 25 08:16:46 2016 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | K | N | F | E | Y | T | I | P | K | F | S | D | D | D | R | A | N | L | F | E | F | L | S | E | E | G | I | T | I | T | E | D | N | N | N | D | P | N | C | K | H | Q | Y | I | M | T | T | S | N | G | D | R | V | R | A | K | I | S | I | Q | F | Q | G | K | Y | L | Q | I | A | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | T | T | S | S | S | S | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | L | I | N | D | F | M | C | S | I | L | N | M | K | E | I | V | E | Q | K | N | K | E | F | N | V | D | I | K | K | E | T | I | E | S | E | L | H | S | K | L | P | K | S | I | D | K | I | H | E | D | I | K | K | Q | L | S | C | S | L | I | M | K | K | I | D | V | E | M | E | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | T | T | T | S | S | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | Y | S | T | Y | C | F | S | A | L | R | A | I | E | G | F | I | Y | Q | I | L | N | D | V | C | N | P | S | S | S | K | N | L | G | E | Y | F | T | E | N | K | P | K | Y | I | I | R | E | I | H | Q | E | T | I | N | G | E | I | A | E | V | L | C | E | C | Y | T | Y | W | H | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | G | G | G | T | T | T | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | ||||||||||||
Sequence | N | R | H | G | L | F | H | M | K | P | G | I | A | D | T | K | T | I | N | K | L | E | S | I | A | I | I | D | T | V | C | Q | L | I | D | G | G | V | A | R | L | K | ||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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