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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5htsF_ | 2.60 | PDB header: cell adhesion | Chain: F: PDB Molecule: cell surface protein spaa; |
Added to library: Sat Jul 23 08:21:06 2016 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | T | Q | N | V | V | L | T | K | Y | G | F | Q | G | V | D | F | T | I | Y | N | V | T | A | N | Y | W | A | S | P | K | D | Y | K | G | S | F | D | S | A | P | V | A | A | T | G | T | T | N | D | K | G | Q | L | T | Q | A | L | P | I | Q | S | K | D | A | S | G | K | T | R | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | T | T | T | T | S | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | A | V | Y | L | F | H | E | T | N | P | R | A | G | Y | N | T | S | A | D | F | W | L | T | L | P | A | K | A | A | A | D | G | N | V | Y | V | Y | P | K | N | V | Q | K | T | T | Y | E | R | T | F | V | K | K | D | A | E | T | K | E | V | L | E | G | A | G | F | K | I | S | N |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | B | S | S | T | T | S | B | T | T | T | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | S | D | G | K | F | L | K | L | T | D | K | D | G | Q | S | V | S | I | G | E | G | F | I | D | V | L | A | N | N | Y | R | L | T | W | V | A | E | S | D | A | T | V | F | T | S | D | K | S | G | K | F | G | L | N | G | F | A | D | N | T | T | T | Y | T | A | V | E | T | N | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | S | B | S | S | T | G | G | G | T | T | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | |||||||||||||||||||
Sequence | P | D | G | Y | D | A | A | A | N | T | D | F | K | A | D | N | S | S | S | D | I | L | N | A | P | S | G | I | L | P | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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