|
| |||||
  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
  |
Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
---|---|---|---|
c5hh7A_ | 1.90 | PDB header: transcription | Chain: A: PDB Molecule: origin of replication complex subunit 1b; |
Added to library: Sat Mar 12 09:43:57 2016 | |
  | |
Links to external resources | |
---|---|
  | 1 | . | . | . | . | . | . | . | . | 10 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 20 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 30 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 40 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 50 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 60 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 70 |
Sequence | K | R | V | Y | Y | N | K | V | E | F | D | E | T | E | F | E | I | G | D | D | V | Y | V | K | R | R | E | D | E | D | P | E | I | E | D | C | Q | I | C | F | K | S | D | T | N | I | M | I | E | C | D | D | C | L | G | G | F | H | L | K | C | L | K | P | P | L | K | E | V | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | T | T | T | S | S | B | T | T | T | S | S | T | T | T | G | G | G | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | E | G | D | W | I | C | Q | F | C | E | V | K | A | R | T | M | R | E | K | L | L | S | G | D | L | W | A | A | R | I | D | K | L | W | K | E | V | D | D | G | V | Y | W | I | R | A | R | W | Y | M | I | P | E | E | T | V | S | G | R | Q | P | H | N | L | K | R | E | L | Y | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | S | T | T | T | G | G | G | S | T | T | T | T | T | T | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . |
Sequence | T | N | D | F | A | D | I | E | M | E | C | I | L | R | H | C | S | V | K | C | P | K | E | F | S | K | A | S | N | D | G | D | D | V | F | L | C | E | Y | E | Y | D | V | H | W | R | S | F | K | R | L | A | ||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | G | G | G | T | T | S | T | T | T | T | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
Phyre is now FREE for commercial users! All images and data generated by Phyre2 are free to use in any publication with acknowledgement Accessibility Statement
|