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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5hd9A_ | 1.94 | PDB header: viral protein | Chain: A: PDB Molecule: encapsidation protein; |
Added to library: Sat Mar 12 08:44:14 2016 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | S | L | F | Y | N | P | Q | K | X | L | S | Y | D | R | I | L | N | F | V | I | G | A | R | G | I | G | K | S | Y | A | X | K | V | Y | P | I | N | R | F | I | K | Y | G | E | Q | F | I | Y | V | R | R | Y | K | P | E | L | A | K | V | S | N | Y | F | N | D | V | A | Q | E | F |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | S | S | S | S | S | G | G | G | G | T | T | G | G | G | G | G | G | G | T | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | P | D | H | E | L | V | V | K | G | R | R | F | Y | I | D | G | K | L | A | G | W | A | I | P | L | S | V | W | Q | S | E | K | S | N | A | Y | P | N | V | S | T | I | V | F | D | E | F | I | R | E | K | D | N | S | N | Y | I | P | N | E | V | S | A | L | L | N | L | X | D | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | T | T | G | G | G | T | T | S | S | S | T | S | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . |
Sequence | V | F | R | N | R | E | R | V | R | C | I | C | L | S | N | A | V | S | V | V | N | P | Y | F | L | F | F | N | L | V | P | D | V | N | K | R | F | N | V | Y | D | D | A | L | I | E | I | P | D | S | L | D | F | S | ||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | S | S | S | S | T | T | T | S | S | S | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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