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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5h8aB_ | 1.75 | PDB header: rna binding protein | Chain: B: PDB Molecule: yth domain-containing protein mmi1; |
Added to library: Sat Jan 16 08:24:46 2016 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | P | P | P | L | N | F | S | R | A | S | E | H | R | N | E | K | G | E | R | I | S | M | I | N | P | R | V | V | L | D | E | N | G | I | S | H | R | S | R | Y | F | I | M | L | C | D | N | E | T | A | I | A | H | A | K | K | T | S | I | W | A | V | K | K | D | S | S | K | R | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | G | G | G | B | T | T | S | S | S | T | T | S | T | T | S | B | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | S | D | A | Y | K | K | A | S | V | Y | F | I | F | V | A | Q | Q | T | Y | N | A | L | G | Y | A | Q | V | V | S | D | L | N | S | T | E | L | P | F | W | S | D | S | S | H | A | G | G | V | R | I | K | W | I | K | T | C | N | L | F | S | A | E | I | S | E | I | V | S | H | M |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | S | B | T | T | T | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | |||||||||||||||||||||||
Sequence | D | H | G | S | E | A | R | D | G | M | E | M | M | Y | D | E | G | S | R | L | C | T | L | I | N | Y | A | I | M | K | R | I | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | T | T | B | T | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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