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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5h68B_ | 1.98 | PDB header: dna binding protein, cell cycle | Chain: B: PDB Molecule: chromosome partition protein smc; |
Added to library: Sat Mar 18 09:09:57 2017 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | M | F | L | K | R | L | D | V | I | G | F | K | S | F | A | D | R | V | S | I | E | F | V | P | G | V | T | A | V | V | G | P | N | G | S | G | K | S | N | I | T | D | A | I | R | W | V | L | G | E | Q | S | A | K | S | L | R | G | A | K | M | E | D | V | I | F | A | G | S | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | B | T | T | B | S | S | S | S | T | T | S | S | T | T | T | G | G | G | T | S | S | G | G | G | G | B | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | S | R | K | P | L | N | V | A | E | V | T | I | T | L | D | N | E | D | G | F | L | P | L | E | Y | Q | E | V | S | V | T | R | R | V | Y | R | S | G | E | S | E | F | F | I | N | R | Q | P | C | R | L | K | D | I | V | D | L | F | L | D | S | G | L | G | K | E | A | F | S | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | S | S | T | T | S | T | T | T | T | T | T | T | B | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | I | G | Q | G | R | V | E | E | I | L | S | S | K | P | E | E | R | R | T | I | F | E | E | A | A | G | V | G | G | G | S | G | E | E | M | K | K | R | F | L | T | T | F | E | Q | I | R | A | H | F | G | E | V | F | G | E | L | F | G | G | G | R | A | D | L | R | L | T | D | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | T | T | T | S | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | N | D | L | L | E | T | G | I | D | I | V | A | Q | P | P | G | K | K | L | Q | H | L | S | L | L | S | G | G | E | R | A | L | T | A | I | A | L | L | F | S | I | L | K | V | R | P | V | P | F | C | V | L | D | Q | V | E | A | A | L | D | E | A | N | V | Q | R | Y | A | Q | Y |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | G | G | G | S | S | S | S | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 330 | . | . |
Sequence | L | K | R | F | S | R | D | T | Q | F | I | V | I | T | H | R | K | G | T | M | E | E | A | D | V | L | Y | G | V | T | M | Q | E | S | G | V | S | K | L | V | S | V | R | L | E | D | S | K | E | L | V | R | ||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | T | T | S | S | S | T | T | G | G | G | T | T | S |
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