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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5ghaC_ | 2.50 | PDB header: transferase/transport protein | Chain: C: PDB Molecule: veg136 protein; |
Added to library: Sat May 6 08:26:21 2017 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | V | C | K | V | C | G | Q | K | A | Q | V | E | M | R | S | R | G | L | A | L | C | R | E | H | Y | L | D | W | F | V | K | E | T | E | R | A | I | R | R | H | R | M | L | L | P | G | E | R | V | L | V | A | V | S | G | G | K | D | S | L | A | L | W | D | V | L | S | R | L | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | T | T | T | T | T | T | T | T | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | Y | Q | A | V | G | L | H | I | E | L | G | I | G | E | Y | S | K | R | S | L | E | V | T | Q | A | F | A | R | E | R | G | L | E | L | L | V | V | D | L | K | E | A | Y | G | F | G | V | P | E | L | A | R | L | S | G | R | V | A | C | S | A | C | G | L | S | K | R | Y | I | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | N | Q | V | A | V | E | E | G | F | R | V | V | A | T | G | H | N | L | D | D | E | A | A | V | L | F | G | N | L | L | N | P | Q | G | P | V | L | P | E | K | P | G | L | A | A | R | V | K | P | F | Y | R | F | S | E | R | E | V | L | S | Y | T | L | L | R | G | I | R | Y | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | B | T | T | B | T | T | T | T | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | H | E | E | C | A | K | S | L | L | Y | K | E | A | L | N | L | V | E | R | S | M | P | G | A | K | L | R | F | L | D | G | F | L | E | K | I | R | P | R | L | D | A | L | R | E | C | E | R | C | G | Y | P | T | T | G | A | V | C | A | F | C | R | M | W | D | A | V | Y | R | R |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | G | G | G | T | T | T | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | A | K | K | R | K | L | L | P | E | E | V | S | F | R | P | R | V | K | P | L | R | A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | T | T | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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