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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5fywR_ | 4.35 | PDB header: transcription | Chain: R: PDB Molecule: transcription initiation factor iif subunit beta; |
Added to library: Sat May 21 08:45:34 2016 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | D | L | D | L | E | R | S | N | R | Q | V | W | L | V | R | L | P | M | F | L | A | E | K | W | R | L | G | K | I | R | I | N | K | S | K | I | T | L | L | L | N | E | P | H | E | Y | D | L | E | L | T | K | K | V | V | E | N | E | Y | V | F | T | E | Q | T | I | P | K | K | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | A | I | V | G | T | V | C | H | E | C | Q | V | M | P | Y | H | K | I | V | E | Q | R | R | N | I | V | K | E | R | I | T | T | L | D | E | T | V | G | V | T | M | S | H | T | G | M | S | M | R | S | D | N | S | N | F | L | K | V | M | P | K | K | E | I | L | D | Y | L | F | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | ||
Sequence | L | F | D | E | Y | D | Y | W | S | L | K | G | L | K | E | R | T | R | Q | P | E | A | H | L | K | E | C | L | D | K | V | A | T | L | V | K | K | G | P | Y | A | F | K | Y | T | L | R | K | E | E | E | R | K | A | T | L | G | E | L | |||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | B | S | S | S | S | T | T | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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