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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5furK_ | 8.50 | PDB header: transcription | Chain: K: PDB Molecule: transcription initiation factor tfiid subunit 6; |
Added to library: Sat Apr 9 08:36:27 2016 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | I | H | E | L | S | V | E | Q | Q | L | Y | Y | K | E | I | T | E | A | C | V | G | S | C | E | A | K | R | A | E | A | L | Q | S | I | A | T | D | P | G | L | Y | Q | M | L | P | R | F | S | T | F | I | S | E | G | V | R | V | N | V | V | Q | N | N | L | A | L | L | I | Y | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | S | S | S | S | G | G | G | T | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | M | R | M | V | K | A | L | M | D | N | P | T | L | Y | L | E | K | Y | V | H | E | L | I | P | A | V | M | T | C | I | V | S | R | Q | L | C | L | R | P | D | V | D | N | H | W | A | L | R | D | F | A | A | R | L | V | A | Q | I | C | K | H | F | S | T | T | T | N | N | I | Q |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | |||
Sequence | S | R | I | T | K | T | F | T | K | S | W | V | D | E | K | T | P | W | T | T | R | Y | G | S | I | A | G | L | A | E | L | G | H | D | V | I | K | T | L | I | L | P | R | L | Q | Q | E | G | E | R | I | R | S | V | L | D | G | P | ||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | G | G | G | G | G | G | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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