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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5fsrB_ | 2.40 | PDB header: hydrolase | Chain: B: PDB Molecule: d-alanyl-d-alanine carboxypeptidase dacd; |
Added to library: Sat Jun 11 08:24:10 2016 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | H | H | S | E | N | I | P | F | S | P | Q | P | P | E | I | H | A | G | S | W | V | L | M | D | Y | T | T | G | Q | I | L | T | A | G | N | E | H | Q | Q | R | N | P | A | S | L | T | K | L | M | T | G | Y | V | V | D | R | A | I | D | S | H | R | I | T | P | D | D | I | V | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | T | T | T | S | T | T | B | G | G | G | T | T | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | V | G | R | D | A | W | A | K | D | N | P | V | F | V | G | S | S | L | M | F | L | K | E | G | D | R | V | S | V | R | D | L | S | R | G | L | I | V | D | S | G | N | D | A | C | V | A | L | A | D | Y | I | A | G | G | Q | R | Q | F | V | E | M | M | N | N | Y | A | E | K | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | T | T | T | T | T | T | T | S | T | T | T | S | S | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | H | L | K | D | T | H | F | E | T | V | H | G | L | D | A | P | G | Q | H | S | S | A | Y | D | L | A | V | L | S | R | A | I | I | H | G | E | P | E | F | Y | H | M | Y | S | E | K | S | L | T | W | N | G | I | T | Q | Q | N | R | N | G | L | L | W | D | K | T | M | N | V | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | B | S | S | S | S | T | T | S | S | B | B | T | S | G | G | G | G | T | T | S | G | G | G | G | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | G | L | K | T | G | H | T | S | G | A | G | F | N | L | I | A | S | A | V | D | G | Q | R | R | L | I | A | V | V | M | G | A | D | S | A | K | G | R | E | E | E | A | R | K | L | L | R | W | G | Q | Q | N | F | T | T | V | Q | I | L | H | G | T | E | Q | E | F | W | M | V | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||
Sequence | P | K | A | E | I | P | H | I | K | A | K | Y | T | L | D | Q | R | V | G | E | I | E | L | Y | D | R | D | K | Q | V | A | H | W | P | L | V | T | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | G | G | G | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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