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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5fraD_ | 2.00 | PDB header: sugar binding protein | Chain: D: PDB Molecule: sialidase; |
Added to library: Sat Jul 23 08:23:54 2016 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | P | N | W | E | L | L | S | S | L | G | E | Y | K | D | I | N | L | E | S | S | N | A | S | N | I | T | Y | D | L | E | K | Y | K | N | L | D | E | G | T | I | V | V | R | F | N | S | K | D | S | K | I | Q | S | L | L | G | I | S | N | S | K | T | K | N | G | Y | F | N | F | Y |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | T | G | G | G | G | G | G | T | T | T | S | S | S | S | T | T | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | V | T | N | S | R | V | G | F | E | L | R | N | Q | K | N | E | G | N | T | Q | N | G | T | E | N | L | V | H | M | Y | K | D | V | A | L | N | D | G | D | N | T | V | A | L | K | I | E | K | N | K | G | Y | K | L | F | L | N | G | K | M | I | K | E | V | K | D | T | N | T | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | T | T | S | S | T | T | T | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . |
Sequence | F | L | N | N | I | E | N | L | D | S | A | F | I | G | K | T | N | R | Y | G | Q | S | N | E | Y | N | F | K | G | N | I | G | F | M | N | I | Y | N | E | P | L | G | D | D | Y | L | L | S | K | T | G | E | T | K | ||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | S | T | T | S | S | T | T | S | S | G | G | G |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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